Frequency Domain Multichannel Deconvolution für die Markerdiskriminierung (FreeDoM)

Ziel ist die Erforschung einer neuartigen Plattform für digitale Multiplex-Assays. Die Plattform besteht aus einem zentrifugalmikrofluidischen PCR-Gerät, einem mikrofluidischen Chip zur Emulsion eines Reaktionsmixes und einem zu entwickelnden Auslesegerät mit hohem Multiplexgrad.

Ziel ist die Erforschung einer neuartigen Plattform für digitale Multiplex-Assays. Die Plattform besteht aus:

1. Einem entwickelten und zertifizierbaren zentrifugalmikrofluidischen Gerät inklusive der Möglichkeit Temperaturzyklen zur Durchführung einer PCR zu fahren.
2. Einem zentrifugalmikrofluidischen Chip, mit welchem in der Vergangenheit die Emulsion eines Reaktionsmixes sowie digitale Amplifikationsmethoden demonstriert wurde. Forschungsbedarf besteht hinsichtlich Tropfenstabilität bei der ddPCR.
3. Einem in diesem Projekt zu entwickelndem Auslesegerät, bei der die einzelnen Farbkanäle durch unterschiedliche Modulationsfrequenzen der Anregungslichtquellen codiert werden. Angestrebt werden 6 Farbkanäle. Zusätzlich wird der Multiplexgrad weiter erhöht auf insgesamt 12plex, indem Fluorophore gleicher Emission aber unterschiedlicher Fotostabilität eingesetzt werden. Unterschieden werden diese, indem zwischen zwei Ausleseschritten das weniger fotostabile Fluorophor mittels Lichteintrag gebleicht wird.