Automatisierte Probenvorbereitung für die proteomische Analyse von infektionsbiologisch relevantem Kohortenmaterial durch Massenspektrometrie (NanoPrep)

Die biologische Massenspektrometrie entwickelt sich zunehmend zum Standardwerkzeug der Laboratoriumsmedizin. Vermehrt durchgeführt werden sogenannte Massenspektrometrie basierte Kohortenscreenings, deren Ziel es ist, eine hohe Genauigkeit und statistische Signifikanz für klinische Biomarker zu erreichen.

Allerdings stehen in vielen hierfür durchgeführten klinischen Studien nur geringste Probenmengen (5-20µl) von Körperflüssigkeiten zur Verfügung, die vornehmlich manuell für massenspektrometrische Analysen aufbereitet werden. Bis heute gibt es keine nennenswerte Robotertechnik, die in der Lage ist, Probenmengen dieser Größenordnung stabil und im Hochdurchsatz zu bearbeiten. Die Folge davon ist, dass die Probenvorbereitung fehleranfällig (CV >10%) und aufwendig von Hand durchgeführt werden muss.

Dieser Mangel im Stand der Technik soll in diesem Vorhaben adressiert werden und es ermöglichen, Biomarker in Körperflüssigkeiten, welche oft geringe Mengenänderungen aufweisen mit hoher Sensitivität und Spezifität zu detektieren. Entwickelt wird eine automatisierte, präzise und  reproduzierbare Handhabung kleinster Probenmengen (<1µl) von Körperflüssigkeiten. Mittels zentrifugaler Mikrofluidik wird der enzymatische Verdau von Proteinen zu einem Peptidgemisch sowie dessen Aufreinigung automatisiert.

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PROJECT FOOTNOTE:

Sponsor: Bundesministerium für Wirtschaft und Energie
Promoter: AiF
Funding Number: IGF-Vorhaben Nr. 19456 BG
Duration: 01.04.2017 to 30.09.2019
Cooperation Partner: Universitätsmedizin Greifswald
Maturity Level: Research > Research pattern

Contact

Dr.-Ing. Tobias Hutzenlaub
Hahn-Schickard,
Freiburg
Phone: +49 761 203-73269
Tobias.Hutzenlaub@Hahn-Schickard.de
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